Водные ресурсы играют важную роль в устойчивом развитии Томской агломерации. На примере анализа скважины, расположенной в п. Аникино, выявлены вызовы и сильные стороны развития системы водоснабжения. К вызовам относятся ограниченность ресурсов поверхностных незагрязненных вод, высокое природное содержание в подземных водах железистых и марганцевых соединений, чувствительность системы подземных вод к антропогенному воздействию. Сильными сторонами являются применение современных технологий водоподготовки и высокий уровень автоматизации процессов. Предложены решения, включающие модернизацию технологий объектов, усиление охраны водных ресурсов и развитие мониторинга качества воды.